从事基因组技术研究的研究机构需要进行大量计算并拥有大量数据资源。计算技术能力不足的研究所经常面临扩展性不足的问题,这会导致基因组测序新方法和新技术研究放慢。
新加坡新技术研究局基因组研究所(GIS)通过与英国电信(BT)合作,增强了现有的基因组分析能力,以创建基于云技术的新一代测序技术(NGS)环境。新一代基因测序技术的优势在于它缩短了新加坡新技术研究局基因组研究所(GIS)开发新一代测序技术分析软件的时间,并且可以共享给更多的研究机构和外部各方使用。
新加坡新技术研究局基因组研究所(GIS)所长Ng Huck Hui博士说:“和英国电信(BT)的合作与我们将技术、遗传学及生物学进行整合以对社会带来积极影响的目标相符合。通过这种合作,我们将能够加快我们研究成果商业化并最终进入临床应用的进程,对复杂的新一代测序技术数据进行分析,加快疾病病因分析算法的开发。”
BT将授权基因组研究所使用以BT生命科学平台为基础建立的BT云计算基础架构。基因组研究所以计算为主的工作及测试工作将转移至云端,从而增强其性能。
BT亚太、中东及非洲区总裁Kevin Taylor说:“开发疾病治疗方法常常急需大量的计算工作,而这也是生命科学行业面临的一个主要挑战。BT生命科学平台提供了基于云技术的安全方法,缩短了将必要的计算平台加以组合的时间,从而使软件运行的时间大大缩短。这项创造性的技术组合帮助生命科学行业将云计算带来的好处变为现实。它与基因组研究所利用科学作为为人类健康谋求更大利益的手段这一愿景相一致。通过双方的合作,我们将帮助基因组研究所带来能够造福整个社会的研究成果。”
基因组研究所的首席科学计算执行官Fu Zhiyan博士说:“在基因组研究所,我们已经开发出了电脑处理流程来分析新一代基因测序技术数据,并在内部IT架构中运行这些流程。这种云计算新技术扩展了我们的内部架构,以应对计算量的激增。这种技术还将基因组研究所的算法提供给全世界的研究者们使用,使研究所为全球研究合作做出了更多的贡献。
基因组研究所开发的算法使科学家们能够对组织样本中的各种因素进行测试。通过利用不同的算法(通常视为一套调查工具),科学家能够获得对诸如癌症研究至关重要的精准信息。
GIS计算实验室开发出诸多算法,让科学家能够确定基因组学数据中的重要信号。通过利用不同的算法,科学家可以为重要的研究项目获取更加精准确切的信息,比如癌症研究。